Filmen Æsketroldene foregår i den ildelugtende by Cheese Bridge, hvor borgere hver aften låser sig inde i frygt for de papkasseklædte monstre kaldet æsketrolde.
De bor i byens kloakker, men kommer om natten op på gadeplan for at samle affald. Hvad ingen ved, er, at de skræmmende bæster i virkeligheden er uden skyggen af ondskab.
Æsketroldene er kærlige væsener, der har taget en forældreløs dreng til sig og opdraget ham som en af deres egne under jorden. Da byen får besøg af en hæmningsløs skadedyrsbekæmper, der ønsker at udrydde troldene én gang for alle, må den unge dreng vende tilbage til sine medmennesker og forsøge at redde sin upopulære familie.